2013年二连浩特市文体局对伊林驿站遗址设立网围栏加以保护。
2017年,内蒙古自治区博物院、内蒙古自治区考古所对遗址进行清理考古挖掘,揭露面积6700平方米,发现有院落、房间、灰堆及柱洞等遗迹。出土600多件文物标本,包括瓷器、陶器、木器等。伊林驿站遗址西北500米处有附属设施古车辙印遗迹(清代车辙遗迹),遗迹残留区域东西宽600米、南北长1000米,保护面积约7481.3平方米;遗址向东200米处为附属设施张库大道区域,保护范围5400平方米;遗址向南272米处有驿站所使用过的两处古水井,保存完好,至今周边牧民仍在使用。
2020年6月份开始,二连浩特市文物局通过实地勘察、测量、招标等程序,对伊林驿站遗址及附属设施古车辙遗迹重新加设网围栏保护及设立保护标志碑。伊林驿站遗址网围栏保护面积约7500平方米,古车辙遗迹网围栏保护面积为7481.3平方米,确保重点文物保护单位绝对安全。